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在加盟清华之前，李菂教授是中国科学院国家天文台二级研究员。李菂教授从2008年起任FAST（中国天眼）项目科学家、2018年至今担任FAST首席科学家，主要从事天体物理及空间科学方面的研究，是国际著名的射电天文学家。在河内恒星形成的观测研究、射电天文仪器和技术、天体化学和光谱学、脉冲星搜索及快速射电暴、数据分析算法等方面作出了重要的原创性贡献。

李菂教授曾获全国创新争先奖、美国国家科学委员会学者奖、中国科学院杰出科技成就奖、2023年度影响力人物“年度科技人物”奖等，并于近日（欧洲中部时间2024年7月9日）获得了第十七届马塞尔·格罗斯曼奖。马塞尔·格罗斯曼奖被视为国际物理学界最重要的奖项之一香港六开历史记录，历届获奖人包括诺贝尔奖得主及杨振宁、李政道、丘成桐等数位华裔科学家。李菂教授是首位凭借在中国国内取得的学术成果获得马塞尔·格罗斯曼奖的科学家。

清华大学天文系的前身是天体物理中心，成立于2001年，隶属于物理系，并由李惕碚院士担任主任。2014-2019年，在学校的大力支持下，天体物理中心进入新的发展阶段，中心新增了星系宇宙学和系外行星两大前沿方向，形成了一个学科布局更为合理、中青年结合的学术梯队。在此基础上，清华大学决定成立天文系，于2019年4月21日举行了成立大会。